董耀(谭凯 饰)和陈建波(周晓鸥 饰)的供词，纷纷指认高明远(王志飞 饰)让他们杀害麦自立并掩埋尸体。可高明远一再否认自己认识麦自立，他没有杀人动机。警方连审了两轮，都没能突破高明远的心理防线，何勇(刘奕君 饰)和骆山河(刘之冰 饰)说，高明远非常狡猾，他从来不对手下人直接下命令，而是让人揣摩他的想法。他也从不向手下人暴露他的作案动机，所以目前单凭董耀、陈建波和曹鹏(赵小锐 饰)的口供，很难给高明远定罪。寻找接下来的突破口，成为重中之重。何勇分析，麦自立案暴露后，高明远所做的事都是为了保护和隐藏高赫。
坊间也有传闻说高明远被捕入狱，但老百姓都不相信高明远真的被抓了，所以也不敢站出来指认，这对警方的调查取证工作造成不小的困难。八通大厦是绿藤市黑恶势力的代表和象征，骆山河决定毁掉这座烂尾楼，让老百姓看看他们这次扫黑除恶的决心。郑毅红(王骏迪 饰)开车想离开绿藤，但还是被警方拦下来。郑毅红不愿意交代任何事情，何勇告诉她，警方在她开走的那辆车底下，警方发现了一枚定时炸弹。闻言，郑毅红愣住，最终全部交代犯罪事实，并指认高明远。再之后，何勇和警方大张旗鼓地在媒体的现场播报下，准备开始八通大厦的爆破过程。
在爆破开始之前，何勇作为发言人发言。他表明这次督导组扫黑除恶的决心，并准备让这座象征着黑恶势力的八通楼在大家面前土崩瓦解。他还向大家保证，只要有人敢站出来举报黑恶势力，他们保证一定会打击老百姓所举报的任何一个黑恶势力。随着爆破按钮的摁下，八通楼轰然倒塌，盘踞在绿藤多年的毒刺、毒瘤，终于即将被连根拔起。很快，群众中支持扫黑除恶的声音和反响越来越大，举报信和举报材料纷至沓来，督导组对这些案件进行分类汇总，并以此摸清了高明远犯罪集团的组织脉络和成员关系。
埋藏在绿藤市地下十四年的真相被缓缓道出，直接或间接参与麦自立案、马帅(宁理 饰)案和薛梅(曹艳艳 饰)案的人，都将受到法律的制裁。警方将证据摊在高明远面前，高明远依旧不认罪。何勇则搬出郑毅红，高明远得知郑毅红没有死，终于开始紧张起来。何勇同他强调，不管他是否认罪，在完整的证据链面前，等待他的将是法律正义的审判。案件逐渐清晰，这些都不是个案，而是串成网的，天网恢恢疏而不漏，高明远再怎么也想抵赖，也终是不能逃过法律的制裁。与此同时，王政(郑晓宁 饰)也被纪委带走调查。
经过一个多月的时间，督导组终于圆满完成工作，骆山河发表讲话，为这次中央下沉地方进行扫黑除恶工作画上一个圆满的句号。督导组即将离开绿藤市，骆山河说接下来的工作就要交给赵立根(侯长荣 饰)他们了，赵立根表示他们一定会不辱使命。李成阳(孙红雷 饰)看着网上的新闻，终于露出了久违的发自内心的笑容。李成阳剃掉胡子，去到高明远等人的庭审现场。以高明远为组织者、领导者，以郑毅红、曹鹏等为骨干成员，以陈建波、曹晓峰(姜寒 饰)、杨冬(杨奇雨 饰)等21人为组织成员的黑社会性质组织，彻底暴露在大众面前。
法庭上，高明远犯各种罪，分别各判不同刑罚，这些刑罚加起来，被处以死刑立即执行，并处没收个人全部财产。黑恶势力犯罪集团被彻底捣毁，为高明远犯罪集团充当保护伞的王政、武双岭、贺芸(吴越 饰)被另案处理，得到他们应有的惩罚。其余的郑毅红、陈建波等人，亦被判处各种刑罚。正义可能会迟来，但终将不会缺席，坏人自己种下的恶果，迟早就要自食。
贺芸在接受调查的时候，写了一封信，托人转交给林浩(张艺兴 饰)。贺芸在信中忏悔，林浩读罢，满腔心酸。孙兴(吴晓亮 饰)即将被执行死刑，他脸上终于再也没有那种嚣张跋扈的神情，取而代之的是一脸悔恨、痛苦。他想见见贺芸，但何勇说她在服刑，他只转告了几句贺芸转达给孙兴的话。再过几个小时，孙兴即将要被执行死刑，他吓得忍不住尿裤子了。自扫黑除恶以来，一大批黑恶势力被捣毁，人民的生活过得越来越好。李成阳重回警察队伍，与林浩成为搭档，而林浩也和黄希(江疏影 饰)组成了家庭，有了他们自己的孩子。
李成阳和林浩去执行任务，他忽然看到了一家熟悉的小鱼馄饨店，走进去，果然看到了熟悉的京京，他问起让京京熟悉的问题，两人对视后相视一笑，或许这就是李成阳的情感归属吧。
全剧终。